La parrocchia è stata eretta il 3 febbraio 1963 con il decreto del Cardinale provicario Luigi Traglia "Paterna sollicitudine" ed affidata al clero diocesano di Roma.

La costruzione della chiesa di S. Ponziano è stata ultimata nel 1974.

La vicecura è stata istituita il 17 dicembre 1954 dal Cardinale Vicario Clemente Micara e dichiarata dipendente dalla parrocchia di S. Maria Assunta al Tufello. La parrocchia è stata eretta il 3 febbraio 1963 con il decreto del Cardinale provicario Luigi Traglia "Paterna sollicitudine" ed affidata al clero diocesano di Roma. La prima sede provvisoria era la cappella delle Suore degli Angeli in Via Monte Fumaiolo, la seconda un locale sotto un palazzo in Via Albertazzi. Un ambiente più piccolo in Via Oliva fungeva da luogo sussidiario di culto con il nome di Cappella di S. Elena. I primi sacerdoti di S. Ponziano furono Don Fernando Dalla Libera e Don Gianni Todescato, coadiuvati da Don Siro Todescato. Nel 1963 arrivò Don Aurelio, che resse la parrocchia per ben 37 anni, fino alla sua morte nel 2000.

San Ponziano è Papa e Martire. Fu eletto nel 231. Quattro anni dopo fu relegato in Sardegna dall'imperatore Massimino insieme al sacerdote Ippolito. Lì morì dopo aver rinunziato alla sua dignità. Fu sepolto nel cimitero di Callisto. Ponziano e Ippolito vengono festeggiati il 13 agosto.

Secondo la tradizione Ippolito, avendo idee teologiche diverse da Ponziano, ne avrebbe contestato l'elezione al Pontificato, divenendo antipapa. Una volta condannati entrambi all'esilio, i due si sarebbero riconciliati: Ippolito avrebbe rinunciato allo scisma e Ponziano si sarebbe dimesso, permettendo così l'elezione del suo successore. Se tutto ciò fosse vero, Ponziano avrebbe tre caratteristiche davvero degne di nota: sarebbe il primo Papa ad essersi dimesso, sarebbe diventato martire senza essere stato ucciso (nelle miniere in Sardegna si moriva di stenti) e sarebbe venerato come santo insieme al suo antipapa. Ponziano e Ippolito vengono infatti festeggiati insieme il 13 di agosto.